Pemerintah Indonesia memastikan bahwa lokasi penyelenggaraan Pekan Olahraga Nasional (PON) XX 2021 Papua berada di zona yang relatif aman. Penyelenggaraan PON XX 2021 Papua memperhatikan aspek kesehatan secara seksama.
Adapun cakupan vaksinasi Covid-19 di 5 daerah penyelenggara secara keseluruhan telah 60% per-30 September 2021.
Vaksin dosis pertama telah diterima 406.531 orang atau sebesar 62% dari sasaran vaksinasi yang mencapai 648.622 orang.
Vaksin dosis kedua sudah diterima sebanyak 253.474 orang (39% dari sasaran vaksinasi).
Saat ini, daerah yang menyelenggarakan masuk ke dalam wilayah Pemberlakuan Pembatasan Kegiatan Masyarakat (PPKM) level 2 atau berkategori terkendali.